El Conservatorio posee infinidad de características que lo distinguen significativamente de otros tipos de institución educativa.  El rigor académico y su alta especialización lo convierten en una entidad única en su género en el Perú.  Las experiencias vividas a lo largo de más de 101 años han demostrado que el Conservatorio, para atender eficientemente a sus fines, requiere necesariamente gobernarse de manera autónoma.   Actualmente se rige por su Estatuto, Reglamento General, Reglamento Académico y otras normas; sus autoridades son elegidas por asamblea universal. La Ley Nº 28329 modifica la undécima disposición complementaria de la Ley Nº 28044, Ley General de Educación, ratificando su autonomía y la Ley 29292 lo faculta para otorgar grados y títulos equivalentes a los que expiden las universidades del país.

A diferencia de otras iniciativas esporádicas, esta casa de estudios ha sido la única FUENTE PERMANENTE de profesionales que ha alimentado la vida musical del Perú: la Orquesta Sinfónica Nacional, el Coro Nacional, las temporadas de ópera, las agrupaciones de música popular o folclórica de calidad, existen y están compuestas, en su gran mayoría, por ex alumnos del Conservatorio;  y quienes emigraron, contribuyen a su patria dejando siempre muy en alto el nombre del Perú e insertando nuestro patrimonio cultural dentro de la cultura musical universal.